上面都是优点，独角兽号也有一定缺陷。因为体型小，哪怕搭载艾兰特文明最先进的反应炉，负载力也不可能与炽天使号、座天使号这类大、中型舰比较，而且三路推进系统与构建广域拦截网又分流掉不少能量，使得独角兽号只能搭载简化版能量护盾，根据艾玛提供的对比图，护盾强度不足炽天使号的60%……不过还是高出冥蝠级驱逐舰大约20个百分点。
还有，独角兽号在维持曲速拦截网过程中由于能量供应问题与硬件原因无法移动，那将让它成为一个标靶。不过艾兰特人针对这一问题进行了局部优化，透过更加合理地资源分配机制，在不影响拦截网稳定的基础上，分流出一股能量，用于维持战舰主炮运作。于是拦截模式下的独角兽号既是一台曲速拦截设备，又是一台定点防御炮塔。
除去拦截模式，独角兽号还有另一个应用模式------毁灭模式。这当然不是什么自我毁灭机制。在该模式下，独角兽号尾部2个菱形构造之间角度大幅缩小，与另1个菱形构造的角度大幅增加，形成双菱并拢为腿，单菱凸显为首的情况，从而变得更具流线型美感……就像当下的独角兽号。
不同于拦截模式，毁灭模式下的独角兽号拥有不俗的攻击力，起码比唐方手中座天使号、晨星号、权天使号、梦靥号要强大许多……实际上这种强大并非表现在一炮过去能够击沉多大吨位，装甲有多么厚重的战舰上，而是它能够进行覆盖性的多角度并行打击。
独角兽号只有一门炮，听起来很寒酸。但是正如独角兽这种传说祥瑞，它的独角能够放射万丈光芒，驱散黑暗，洗涤心灵。独角兽号的主炮外形酷似多面体晶体球，每一个面都可以发射脉冲激光，虽说攻击力度有限，无法给予250米以上，或者配备新型能量护盾的伊普西龙战舰造成重大伤害，但是对于200米以下的小型舰，却有着难以想象的威胁力。
这一情况有点类似美嘉尔恒星系统伊普西龙跃迁中继站配置的激光炮塔。在独角兽号反应炉健康指数优秀-良好这一区间的时候，该门炮可以同时激发24道激光束。随着战斗时间拉长，舰体部件负担加重，反应炉健康指数会缓慢下降，能够同时激活的射频晶体数量也会相应减少。
独角兽号啃不动座天使号这种配备星光护盾的大型舰，然而对于海魔女那样的小型遗迹战舰，有着极其强大的杀伤力，堪称小型舰杀手……这还是针对伊普西龙与艾兰特这一等级的科技文明战舰而言，如果换成人类战舰呢？想想就叫人不寒而栗。
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