川胜元，这使得山名持丰派的大名感到不满，于是畠山义就趁着畠山政长离开将军府发动攻击。
畠山政长于是向细川胜元求援，细川胜元于是召集京都的同盟守护大名的士兵进行了反击。
在细川胜元的支持下，畠山政长率兵在上御灵社布阵，足利义仁得知畠山家内斗后曾经尝试禁止，山名持丰让后土御门天皇和后花园上皇到室町亭避难。
畠山政长和畠山义就的战争宣告着倭国正式陷入军阀混战时期，以细川胜元和山名持丰为首的大名拉开了乱世混战的帷幕。
而后，细川胜元从领地四国的九个国家集结兵力，令赤松政则从播磨进攻山名持丰的领地。
不仅如此，细川胜元和山名持丰阵营的人在京都也爆发了激烈的冲突，幕府将军足利义仁曾经尝试调停但最终失败。
细川胜元方面有斯波义敏、畠山政长、赤松政则、京极持清等，大本营在将军驻地幕府，称东军。
山名持丰方面有斯波义廉、畠山义就、一色义直、六角高赖等，大本营在幕府以西的山名持丰邸，称西军。
由倭国的北陆到信越、东海、九州筑前、丰后、豊前的大半、关东地方、东北以及九州部份地区的大名都卷入了其中。
最初，号称官军的东军将西军从内里和花的御所周边驱逐，不过西军很快就集结兵力与那个对，两军展开了激烈的战斗，最终不分胜负。
此后京都地区的战斗进入胶着状态，战乱逐渐波及地方。
战争中，东军控制幕府将军足利义仁、后土御门天皇和后花园上皇，西军则控制义视和南朝的后龟山天皇之重孙，双方均以自己为正统，称对方为贼军。
后来发生了一件大事，依附于细川胜元的足利义元突然离开东军并逃到伊势国投靠北畠教具。
足利义元之所以离开的原因是担任足利义元和足利义仁的细川胜元倾向于废足利义元继承人的地位而立足利义尚为将军，没有履行把将军职位让位给足利义元的承诺。
足利义元在伊势国待了一段时间，后来在细川胜元和足利义仁的游下返回东军，但又再次逃走到比睿山。
这给了西军一个机会，西军热烈欢迎被拥戴为“新将军”的足利义元，以与东军对抗，使得战斗更加复杂。
长期的战乱以与盗贼横行使京都市街地荒废，由于地方守护大名的介入使战线拉长，这导致东、西军的厌战气氛增大。
在李云天看来，这场东、西军之间的战
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